Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PACSIN3Q9UKS6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms