Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM4Q9UKN5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms