Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKM9

RALY, RNA-binding protein Raly, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALYQ9UKM9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RALYQ9UKM9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALYQ9UKM9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALYQ9UKM9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RALYQ9UKM9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RALYQ9UKM9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RALYQ9UKM9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RALYQ9UKM9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RALYQ9UKM9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RALYQ9UKM9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RALYQ9UKM9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RALYQ9UKM9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RALYQ9UKM9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RALYQ9UKM9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RALYQ9UKM9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RALYQ9UKM9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RALYQ9UKM9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RALYQ9UKM9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RALYQ9UKM9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RALYQ9UKM9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RALYQ9UKM9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALYQ9UKM9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALYQ9UKM9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALYQ9UKM9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALYQ9UKM9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALYQ9UKM9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALYQ9UKM9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALYQ9UKM9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALYQ9UKM9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALYQ9UKM9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RALYQ9UKM9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RALYQ9UKM9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RALYQ9UKM9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms