Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CHIC2Q9UKJ5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CHIC2Q9UKJ5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CHIC2Q9UKJ5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
CHIC2Q9UKJ5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CHIC2Q9UKJ5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CHIC2Q9UKJ5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CHIC2Q9UKJ5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CHIC2Q9UKJ5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CHIC2Q9UKJ5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CHIC2Q9UKJ5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
CHIC2Q9UKJ5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CHIC2Q9UKJ5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CHIC2Q9UKJ5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CHIC2Q9UKJ5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CHIC2Q9UKJ5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CHIC2Q9UKJ5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CHIC2Q9UKJ5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CHIC2Q9UKJ5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CHIC2Q9UKJ5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CHIC2Q9UKJ5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CHIC2Q9UKJ5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CHIC2Q9UKJ5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CHIC2Q9UKJ5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CHIC2Q9UKJ5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CHIC2Q9UKJ5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
CHIC2Q9UKJ5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CHIC2Q9UKJ5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CHIC2Q9UKJ5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CHIC2Q9UKJ5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CHIC2Q9UKJ5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CHIC2Q9UKJ5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CHIC2Q9UKJ5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CHIC2Q9UKJ5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CHIC2Q9UKJ5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms