Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CROTQ9UKG9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CROTQ9UKG9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms