Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXL4Q9UKA2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXL4Q9UKA2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms