Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK11

ZNF223, Zinc finger protein 223, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF223Q9UK11 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF223Q9UK11 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms