Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMTOR3Q9UHA4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms