Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRRDQ9UH36 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRRDQ9UH36 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRRDQ9UH36 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms