Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEPT3Q9UH03 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEPT3Q9UH03 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEPT3Q9UH03 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEPT3Q9UH03 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEPT3Q9UH03 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEPT3Q9UH03 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEPT3Q9UH03 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEPT3Q9UH03 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SEPT3Q9UH03 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEPT3Q9UH03 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEPT3Q9UH03 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.4 ms