Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGXB4Q9UGU5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMGXB4Q9UGU5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HMGXB4Q9UGU5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HMGXB4Q9UGU5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HMGXB4Q9UGU5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGXB4Q9UGU5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGXB4Q9UGU5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGXB4Q9UGU5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGXB4Q9UGU5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGXB4Q9UGU5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGXB4Q9UGU5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGXB4Q9UGU5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGXB4Q9UGU5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms