Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ9

REV1, DNA repair protein REV1, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV1Q9UBZ9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REV1Q9UBZ9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
REV1Q9UBZ9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.7 ms