Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSFQ9UBX1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSFQ9UBX1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSFQ9UBX1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms