Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPARGC1AQ9UBK2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PPARGC1AQ9UBK2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms