Protein–RNA interactions for Protein: Q9P217

ZSWIM5, Zinc finger SWIM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM5Q9P217 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZSWIM5Q9P217 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZSWIM5Q9P217 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZSWIM5Q9P217 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZSWIM5Q9P217 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZSWIM5Q9P217 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZSWIM5Q9P217 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ZSWIM5Q9P217 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZSWIM5Q9P217 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZSWIM5Q9P217 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZSWIM5Q9P217 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZSWIM5Q9P217 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZSWIM5Q9P217 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZSWIM5Q9P217 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZSWIM5Q9P217 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZSWIM5Q9P217 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZSWIM5Q9P217 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZSWIM5Q9P217 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZSWIM5Q9P217 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZSWIM5Q9P217 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ZSWIM5Q9P217 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZSWIM5Q9P217 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZSWIM5Q9P217 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZSWIM5Q9P217 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZSWIM5Q9P217 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms