Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HCN3Q9P1Z3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms