Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PHRF1Q9P1Y6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PHRF1Q9P1Y6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PHRF1Q9P1Y6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PHRF1Q9P1Y6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PHRF1Q9P1Y6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
PHRF1Q9P1Y6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PHRF1Q9P1Y6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PHRF1Q9P1Y6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PHRF1Q9P1Y6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PHRF1Q9P1Y6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PHRF1Q9P1Y6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PHRF1Q9P1Y6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PHRF1Q9P1Y6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PHRF1Q9P1Y6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
PHRF1Q9P1Y6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PHRF1Q9P1Y6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PHRF1Q9P1Y6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PHRF1Q9P1Y6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PHRF1Q9P1Y6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PHRF1Q9P1Y6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PHRF1Q9P1Y6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
PHRF1Q9P1Y6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
PHRF1Q9P1Y6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PHRF1Q9P1Y6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PHRF1Q9P1Y6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
PHRF1Q9P1Y6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PHRF1Q9P1Y6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PHRF1Q9P1Y6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PHRF1Q9P1Y6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms