Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ARHGEF12Q9NZN5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ARHGEF12Q9NZN5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ARHGEF12Q9NZN5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ARHGEF12Q9NZN5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ARHGEF12Q9NZN5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ARHGEF12Q9NZN5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ARHGEF12Q9NZN5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ARHGEF12Q9NZN5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ARHGEF12Q9NZN5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ARHGEF12Q9NZN5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ARHGEF12Q9NZN5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ARHGEF12Q9NZN5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ARHGEF12Q9NZN5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ARHGEF12Q9NZN5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ARHGEF12Q9NZN5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ARHGEF12Q9NZN5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ARHGEF12Q9NZN5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ARHGEF12Q9NZN5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ARHGEF12Q9NZN5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ARHGEF12Q9NZN5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
ARHGEF12Q9NZN5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
ARHGEF12Q9NZN5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.45
ARHGEF12Q9NZN5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.45
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
ARHGEF12Q9NZN5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
ARHGEF12Q9NZN5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ARHGEF12Q9NZN5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ARHGEF12Q9NZN5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ARHGEF12Q9NZN5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
ARHGEF12Q9NZN5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ARHGEF12Q9NZN5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARHGEF12Q9NZN5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARHGEF12Q9NZN5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARHGEF12Q9NZN5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARHGEF12Q9NZN5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
ARHGEF12Q9NZN5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARHGEF12Q9NZN5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARHGEF12Q9NZN5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARHGEF12Q9NZN5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARHGEF12Q9NZN5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARHGEF12Q9NZN5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARHGEF12Q9NZN5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARHGEF12Q9NZN5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARHGEF12Q9NZN5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ARHGEF12Q9NZN5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ARHGEF12Q9NZN5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ARHGEF12Q9NZN5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ARHGEF12Q9NZN5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ARHGEF12Q9NZN5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ARHGEF12Q9NZN5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms