Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRN3Q9NYV6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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