Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKIRAS1Q9NYS0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms