Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTMR4Q9NYA4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTMR4Q9NYA4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MTMR4Q9NYA4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTMR4Q9NYA4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTMR4Q9NYA4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTMR4Q9NYA4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTMR4Q9NYA4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MTMR4Q9NYA4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MTMR4Q9NYA4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MTMR4Q9NYA4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MTMR4Q9NYA4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MTMR4Q9NYA4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MTMR4Q9NYA4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MTMR4Q9NYA4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTMR4Q9NYA4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTMR4Q9NYA4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTMR4Q9NYA4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTMR4Q9NYA4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTMR4Q9NYA4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTMR4Q9NYA4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTMR4Q9NYA4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTMR4Q9NYA4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTMR4Q9NYA4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MTMR4Q9NYA4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MTMR4Q9NYA4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MTMR4Q9NYA4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MTMR4Q9NYA4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MTMR4Q9NYA4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms