Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD3Q9NY59 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD3Q9NY59 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMPD3Q9NY59 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms