Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX58

LYAR, Cell growth-regulating nucleolar protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYARQ9NX58 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYARQ9NX58 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LYARQ9NX58 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LYARQ9NX58 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYARQ9NX58 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYARQ9NX58 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYARQ9NX58 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYARQ9NX58 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYARQ9NX58 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYARQ9NX58 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYARQ9NX58 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYARQ9NX58 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYARQ9NX58 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYARQ9NX58 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYARQ9NX58 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYARQ9NX58 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYARQ9NX58 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYARQ9NX58 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYARQ9NX58 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms