Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH0

EXD2, Exonuclease 3'-5' domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXD2Q9NVH0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXD2Q9NVH0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXD2Q9NVH0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms