Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ECHDC1Q9NTX5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ECHDC1Q9NTX5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ECHDC1Q9NTX5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms