Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
PDS5BQ9NTI5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
PDS5BQ9NTI5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC41.92■■■■■ 4.3
PDS5BQ9NTI5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
PDS5BQ9NTI5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC41.91■■■■■ 4.3
PDS5BQ9NTI5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
PDS5BQ9NTI5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
PDS5BQ9NTI5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
PDS5BQ9NTI5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
PDS5BQ9NTI5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
PDS5BQ9NTI5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
PDS5BQ9NTI5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
PDS5BQ9NTI5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
PDS5BQ9NTI5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
PDS5BQ9NTI5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
PDS5BQ9NTI5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
PDS5BQ9NTI5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.3
PDS5BQ9NTI5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
PDS5BQ9NTI5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
PDS5BQ9NTI5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
PDS5BQ9NTI5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
PDS5BQ9NTI5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
PDS5BQ9NTI5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
PDS5BQ9NTI5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
PDS5BQ9NTI5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
PDS5BQ9NTI5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
PDS5BQ9NTI5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
PDS5BQ9NTI5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
PDS5BQ9NTI5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
PDS5BQ9NTI5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC41.85■■■■■ 4.29
PDS5BQ9NTI5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC41.85■■■■■ 4.29
PDS5BQ9NTI5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
PDS5BQ9NTI5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
PDS5BQ9NTI5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
PDS5BQ9NTI5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
PDS5BQ9NTI5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
PDS5BQ9NTI5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
PDS5BQ9NTI5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
PDS5BQ9NTI5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
PDS5BQ9NTI5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
PDS5BQ9NTI5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
PDS5BQ9NTI5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
PDS5BQ9NTI5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
PDS5BQ9NTI5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
PDS5BQ9NTI5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC41.8■■■■■ 4.28
PDS5BQ9NTI5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
PDS5BQ9NTI5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
PDS5BQ9NTI5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
PDS5BQ9NTI5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
PDS5BQ9NTI5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
PDS5BQ9NTI5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
PDS5BQ9NTI5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
PDS5BQ9NTI5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
PDS5BQ9NTI5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC41.78■■■■■ 4.28
PDS5BQ9NTI5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC41.78■■■■■ 4.28
PDS5BQ9NTI5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
PDS5BQ9NTI5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
PDS5BQ9NTI5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC41.77■■■■■ 4.28
PDS5BQ9NTI5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
PDS5BQ9NTI5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
PDS5BQ9NTI5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
PDS5BQ9NTI5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
PDS5BQ9NTI5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
PDS5BQ9NTI5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
PDS5BQ9NTI5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
PDS5BQ9NTI5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
PDS5BQ9NTI5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
PDS5BQ9NTI5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
PDS5BQ9NTI5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
PDS5BQ9NTI5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
PDS5BQ9NTI5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
PDS5BQ9NTI5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
PDS5BQ9NTI5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC41.73■■■■■ 4.27
PDS5BQ9NTI5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
PDS5BQ9NTI5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
PDS5BQ9NTI5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
PDS5BQ9NTI5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
PDS5BQ9NTI5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC41.71■■■■■ 4.27
PDS5BQ9NTI5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
PDS5BQ9NTI5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
PDS5BQ9NTI5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
PDS5BQ9NTI5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
PDS5BQ9NTI5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.27
PDS5BQ9NTI5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
PDS5BQ9NTI5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
PDS5BQ9NTI5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
PDS5BQ9NTI5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC41.68■■■■■ 4.26
PDS5BQ9NTI5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
PDS5BQ9NTI5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
PDS5BQ9NTI5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
PDS5BQ9NTI5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
PDS5BQ9NTI5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
PDS5BQ9NTI5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
PDS5BQ9NTI5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
PDS5BQ9NTI5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
PDS5BQ9NTI5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
PDS5BQ9NTI5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
PDS5BQ9NTI5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
PDS5BQ9NTI5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
PDS5BQ9NTI5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC41.65■■■■■ 4.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms