Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOMER3Q9NSC5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HOMER3Q9NSC5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOMER3Q9NSC5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms