Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HOMER2Q9NSB8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms