Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT84Q9NSB2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT84Q9NSB2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT84Q9NSB2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT84Q9NSB2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT84Q9NSB2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT84Q9NSB2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT84Q9NSB2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT84Q9NSB2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT84Q9NSB2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT84Q9NSB2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT84Q9NSB2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT84Q9NSB2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT84Q9NSB2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT84Q9NSB2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KRT84Q9NSB2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRT84Q9NSB2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT84Q9NSB2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms