Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHPT1Q9NRX4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHPT1Q9NRX4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHPT1Q9NRX4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms