Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG1

PRTFDC1, Phosphoribosyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRTFDC1Q9NRG1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRTFDC1Q9NRG1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRTFDC1Q9NRG1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRTFDC1Q9NRG1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms