Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GDF3Q9NR23 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDF3Q9NR23 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms