Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIT2Q9NQR4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIT2Q9NQR4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms