Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRTAC1Q9NQ79 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRTAC1Q9NQ79 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRTAC1Q9NQ79 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRTAC1Q9NQ79 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRTAC1Q9NQ79 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRTAC1Q9NQ79 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CRTAC1Q9NQ79 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CRTAC1Q9NQ79 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRTAC1Q9NQ79 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CRTAC1Q9NQ79 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRTAC1Q9NQ79 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRTAC1Q9NQ79 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRTAC1Q9NQ79 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms