Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX9Q9NQ69 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX9Q9NQ69 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms