Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCFQ9NPI8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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