Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC56

PCDH9, Protocadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH9Q9HC56 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH9Q9HC56 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH9Q9HC56 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH9Q9HC56 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH9Q9HC56 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH9Q9HC56 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH9Q9HC56 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH9Q9HC56 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH9Q9HC56 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDH9Q9HC56 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDH9Q9HC56 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDH9Q9HC56 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDH9Q9HC56 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDH9Q9HC56 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDH9Q9HC56 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDH9Q9HC56 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDH9Q9HC56 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDH9Q9HC56 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDH9Q9HC56 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH9Q9HC56 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms