Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9H4

VPS37B, Vacuolar protein sorting-associated protein 37B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37BQ9H9H4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37BQ9H9H4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37BQ9H9H4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37BQ9H9H4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS37BQ9H9H4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS37BQ9H9H4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS37BQ9H9H4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS37BQ9H9H4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS37BQ9H9H4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS37BQ9H9H4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS37BQ9H9H4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS37BQ9H9H4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS37BQ9H9H4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS37BQ9H9H4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS37BQ9H9H4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS37BQ9H9H4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS37BQ9H9H4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS37BQ9H9H4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS37BQ9H9H4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS37BQ9H9H4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS37BQ9H9H4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS37BQ9H9H4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS37BQ9H9H4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS37BQ9H9H4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS37BQ9H9H4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37BQ9H9H4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms