Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPF2Q9H7B2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms