Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RETREG1Q9H6L5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RETREG1Q9H6L5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms