Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM38AQ9H6F2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM38AQ9H6F2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM38AQ9H6F2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms