Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M0

NUP62CL, Nucleoporin-62 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CLQ9H1M0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUP62CLQ9H1M0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP62CLQ9H1M0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP62CLQ9H1M0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP62CLQ9H1M0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP62CLQ9H1M0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP62CLQ9H1M0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP62CLQ9H1M0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP62CLQ9H1M0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP62CLQ9H1M0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP62CLQ9H1M0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP62CLQ9H1M0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP62CLQ9H1M0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP62CLQ9H1M0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP62CLQ9H1M0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP62CLQ9H1M0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP62CLQ9H1M0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP62CLQ9H1M0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP62CLQ9H1M0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP62CLQ9H1M0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP62CLQ9H1M0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP62CLQ9H1M0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP62CLQ9H1M0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP62CLQ9H1M0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP62CLQ9H1M0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP62CLQ9H1M0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP62CLQ9H1M0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms