Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRTNQ9H040 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRTNQ9H040 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms