Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A8Q9C0K1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A8Q9C0K1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms