Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H5

ARHGAP39, Rho GTPase-activating protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP39Q9C0H5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP39Q9C0H5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARHGAP39Q9C0H5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGAP39Q9C0H5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms