Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NMES1Q9C002 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMES1Q9C002 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms