Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM8Q9BZR9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM8Q9BZR9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM8Q9BZR9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms