Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRNKL1Q9BZJ0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRNKL1Q9BZJ0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRNKL1Q9BZJ0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRNKL1Q9BZJ0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRNKL1Q9BZJ0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRNKL1Q9BZJ0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRNKL1Q9BZJ0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRNKL1Q9BZJ0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CRNKL1Q9BZJ0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRNKL1Q9BZJ0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRNKL1Q9BZJ0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRNKL1Q9BZJ0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRNKL1Q9BZJ0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRNKL1Q9BZJ0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRNKL1Q9BZJ0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRNKL1Q9BZJ0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRNKL1Q9BZJ0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRNKL1Q9BZJ0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRNKL1Q9BZJ0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRNKL1Q9BZJ0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CRNKL1Q9BZJ0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRNKL1Q9BZJ0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CRNKL1Q9BZJ0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CRNKL1Q9BZJ0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CRNKL1Q9BZJ0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CRNKL1Q9BZJ0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253.4 ms