Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC46A2Q9BY10 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC46A2Q9BY10 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms