Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1QTNF3Q9BXJ4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms